Une guerre de religion est une Guerre opposant les partisans de religions différentes. En général, le terme est utilisé pour désigner le conflit entre protestants et catholiques au XVIe siècle et XVIIe siècle.

• En France, les guerres de religion constituent une série de huit conflits qui se sont déroulés entre 1562 et 1598.
• En Suisse, les Guerres de Kappel (1529 et 1531) sont les premières guerres de religion qui ont eu lieu en Europe.
• Dans les Pays-Bas espagnols, les guerres de religion ont pris la forme d'une guerre d'indépendance connue sous le nom de Guerre de Quatre-Vingts Ans.
• En Basse-Navarre, royaume distinct du royaume de France au XVIe siècle, une guerre de religion eut lieu de 1560 à 1572 : voir guerre de religion (Navarre).